70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0540 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0540  transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  26.79 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 324 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  27.47 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  22.06 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  22.3 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 312 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 321 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  26.98 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  26.05 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 152 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  26.74 
 
 		 163 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  29.89 
 
 		 151 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  27.78 
 
 		 147 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 143 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 352 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  22.31 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 325 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  21.9 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.38 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  34.38 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 166 aa  40.4  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  23.16 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  23.4 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 326 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 326 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 326 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  32.39 
 
 		 208 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.38 
 
 		 158 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 142 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 183 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>