78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1060 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  36.81 
 
 
1088 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  36.03 
 
 
1070 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  36.03 
 
 
1070 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  36.03 
 
 
1112 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  35.04 
 
 
760 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  38.71 
 
 
772 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  30.86 
 
 
587 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  31.45 
 
 
1052 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  32.88 
 
 
755 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  32.19 
 
 
766 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  34.19 
 
 
760 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  34.19 
 
 
766 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  31.25 
 
 
421 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  33.83 
 
 
284 aa  79  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  31.51 
 
 
542 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  31.51 
 
 
779 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  31.51 
 
 
765 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.68 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  40 
 
 
994 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  30.82 
 
 
772 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  38.4 
 
 
347 aa  75.5  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  38.66 
 
 
498 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  40.48 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  38.26 
 
 
993 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.65 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  35.58 
 
 
789 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  35.58 
 
 
789 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.67 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  26.71 
 
 
1085 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  24.35 
 
 
1351 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  38.03 
 
 
531 aa  68.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  30.43 
 
 
399 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  33.33 
 
 
995 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  32.88 
 
 
858 aa  68.2  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  30.43 
 
 
1266 aa  68.2  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  37.39 
 
 
1012 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.32 
 
 
637 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  29.41 
 
 
954 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  31.45 
 
 
400 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  36.46 
 
 
1011 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  31.62 
 
 
400 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  29.17 
 
 
643 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  40.91 
 
 
399 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  30.33 
 
 
467 aa  62  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  31.09 
 
 
399 aa  61.6  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  35.4 
 
 
692 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  28.67 
 
 
877 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  29.17 
 
 
355 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  28.57 
 
 
718 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  32.97 
 
 
400 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  35.71 
 
 
356 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  20.25 
 
 
565 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  31.86 
 
 
765 aa  52  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  30 
 
 
1744 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0331  hypothetical protein  28.07 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 
539 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0752  hypothetical protein  29.46 
 
 
600 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  29.02 
 
 
1059 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  34.82 
 
 
384 aa  48.9  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  29.6 
 
 
1780 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  28.07 
 
 
374 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2618  hypothetical protein  31.03 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431913  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27807  predicted protein  31.58 
 
 
770 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.555868 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52710  predicted protein  32.29 
 
 
682 aa  45.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  27.27 
 
 
935 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.2 
 
 
482 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  28.16 
 
 
998 aa  45.1  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3929  hypothetical protein  32.22 
 
 
449 aa  44.7  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0885912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.82 
 
 
1107 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  25.97 
 
 
791 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.83 
 
 
354 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  23.76 
 
 
1231 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  26.67 
 
 
279 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  29.92 
 
 
523 aa  42  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  28.69 
 
 
925 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.69 
 
 
1086 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89214  predicted protein  22.73 
 
 
445 aa  41.6  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>