18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0752 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0752  hypothetical protein  100 
 
 
600 aa  1218    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  37.14 
 
 
1351 aa  65.1  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  34.55 
 
 
587 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  38.68 
 
 
1052 aa  63.9  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  44.44 
 
 
640 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  35 
 
 
637 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  29.25 
 
 
789 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  29.25 
 
 
789 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  29.46 
 
 
205 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  30.33 
 
 
284 aa  48.5  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  27.36 
 
 
1070 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  27.36 
 
 
1112 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  27.36 
 
 
1070 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  34.18 
 
 
858 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  29.41 
 
 
1088 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  27.92 
 
 
772 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  33.73 
 
 
1687 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  36 
 
 
643 aa  43.9  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>