More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4197 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  34.87 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  32.57 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  33.48 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  34.21 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  36.15 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.02 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  33.04 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 222 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  36 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  37.85 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.88 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  30 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  33.79 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  33.06 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  32.08 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.48 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  37.35 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.91 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1150  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  36.23 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 		 215 aa  99  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.07 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  34.95 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 218 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  32.88 
 
 		 227 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.12 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  31.12 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 218 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  31.12 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  31.12 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  31.12 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.34 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  31.12 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  31.12 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  31.12 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.32 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.28 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  30.66 
 
 		 239 aa  95.5  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 232 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  28.51 
 
 		 237 aa  95.1  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  30.61 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  30.61 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  30.61 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  32.17 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.93 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.25 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  34.04 
 
 		 299 aa  92.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  32.29 
 
 		 226 aa  92  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  28.77 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  32.27 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  29.73 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  32.5 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.9 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  29.55 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.6 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  29.82 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  30.6 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.17 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  33.33 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>