92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1637 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
623 aa  1264    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1636  hypothetical protein  94.32 
 
 
517 aa  178  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1648  hypothetical protein  57.66 
 
 
572 aa  159  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1087  hypothetical protein  66.67 
 
 
518 aa  141  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0467  hypothetical protein  70.33 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0035824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  55.21 
 
 
318 aa  125  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  50.94 
 
 
334 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1647  hypothetical protein  50.48 
 
 
531 aa  108  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0973  hypothetical protein  47 
 
 
299 aa  108  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.149574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1638  hypothetical protein  26.35 
 
 
623 aa  107  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  50.56 
 
 
239 aa  106  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  46.07 
 
 
315 aa  104  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0986  TPR repeat-containing protein  49.45 
 
 
479 aa  103  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  49.44 
 
 
358 aa  97.8  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  43.48 
 
 
454 aa  97.4  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  44.32 
 
 
270 aa  95.9  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0333  hypothetical protein  31.66 
 
 
1042 aa  95.9  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0030  hypothetical protein  39.55 
 
 
334 aa  94.7  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  41.82 
 
 
539 aa  89.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  39.18 
 
 
287 aa  89.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  48.28 
 
 
152 aa  89.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1684  hypothetical protein  24.89 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.996577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1676  hypothetical protein  22.97 
 
 
573 aa  77.4  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  43.42 
 
 
179 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  40.43 
 
 
771 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1644  hypothetical protein  39.33 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  43.59 
 
 
97 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  46.84 
 
 
280 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  44.16 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  42.17 
 
 
167 aa  66.6  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  38.96 
 
 
112 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  46.27 
 
 
301 aa  65.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 
109 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  40.43 
 
 
173 aa  64.7  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  41.03 
 
 
117 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  37.65 
 
 
136 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  42.86 
 
 
97 aa  63.9  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0875  phosphonate ABC transporter periplasmic phosphonate-binding protein  52.94 
 
 
362 aa  62.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122737 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
336 aa  63.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  40.58 
 
 
456 aa  62.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1142  blue (type1) copper domain-containing protein  38.98 
 
 
153 aa  62.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.036139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  34.83 
 
 
114 aa  62  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  38.16 
 
 
174 aa  61.6  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  37.8 
 
 
149 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  31.82 
 
 
116 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  38.75 
 
 
85 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  39.53 
 
 
120 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1542  blue (type1) copper domain-containing protein  37.1 
 
 
154 aa  60.1  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  35.53 
 
 
72 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  36.25 
 
 
110 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  30.34 
 
 
112 aa  57  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  35.87 
 
 
156 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  31.65 
 
 
112 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  31.65 
 
 
112 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  28.41 
 
 
113 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  31.76 
 
 
113 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  33.6 
 
 
144 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  31.65 
 
 
110 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  30.97 
 
 
192 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  30.12 
 
 
192 aa  55.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0479  phosphate ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  54.05 
 
 
417 aa  54.7  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.719284 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  38.36 
 
 
157 aa  54.7  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  30.38 
 
 
114 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  32.65 
 
 
140 aa  53.9  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  30.38 
 
 
113 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  35.53 
 
 
124 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  28.42 
 
 
114 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  40.54 
 
 
264 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.53 
 
 
749 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 
123 aa  51.6  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1639  hypothetical protein  25.69 
 
 
443 aa  51.2  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  36.25 
 
 
139 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  34.18 
 
 
104 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  29.11 
 
 
112 aa  50.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1195  hypothetical protein  33.78 
 
 
372 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  35.14 
 
 
123 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 
130 aa  49.7  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  36.36 
 
 
119 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  32.56 
 
 
141 aa  48.9  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.38 
 
 
417 aa  48.5  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  37.33 
 
 
119 aa  47.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  35.14 
 
 
126 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  31.07 
 
 
109 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  31 
 
 
137 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  31.65 
 
 
104 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  26.53 
 
 
150 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  37.11 
 
 
235 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  30.77 
 
 
131 aa  45.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  31.11 
 
 
486 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  36.49 
 
 
121 aa  44.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  35.21 
 
 
119 aa  43.9  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  31.65 
 
 
116 aa  43.9  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>