More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0399 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 
238 aa  478  1e-134  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  50.53 
 
 
202 aa  211  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  49.74 
 
 
202 aa  205  5e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  48.96 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  47.64 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  48.7 
 
 
205 aa  198  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  48.17 
 
 
197 aa  198  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  47.92 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  46.67 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  48.72 
 
 
203 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  47.67 
 
 
205 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  45.55 
 
 
202 aa  194  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  47.4 
 
 
205 aa  191  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  46.88 
 
 
214 aa  191  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  46.53 
 
 
229 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  46.88 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  47.12 
 
 
211 aa  188  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  45.54 
 
 
229 aa  188  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  45.54 
 
 
229 aa  188  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  46.32 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  45.5 
 
 
205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  43.39 
 
 
210 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  46.56 
 
 
217 aa  180  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  43.39 
 
 
210 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  45.16 
 
 
215 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  46.91 
 
 
225 aa  176  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  41.4 
 
 
218 aa  168  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  41.94 
 
 
221 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  42.64 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  45.64 
 
 
264 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  39.69 
 
 
273 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  43.3 
 
 
259 aa  148  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  43.08 
 
 
252 aa  144  9e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  34.87 
 
 
203 aa  86.7  3e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  37.09 
 
 
173 aa  85.5  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  33.12 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  35.92 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  35.92 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  35.33 
 
 
168 aa  82  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  32.39 
 
 
147 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  34.03 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  33.8 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  32.39 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  31.69 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  35.76 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  31.82 
 
 
146 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  31.69 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  31.69 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  30.99 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  29.93 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  31.69 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  33.11 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  33.11 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  34.46 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1308  30S ribosomal protein S5  33.77 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  33.11 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  29.81 
 
 
172 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  31.62 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  28.86 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  30.88 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  30.88 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  30.88 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  30.88 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  30.88 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  30.07 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  30.88 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5053  30S ribosomal protein S5  29.05 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  30.88 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  30.88 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  30.88 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  33.33 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  29.58 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  29.45 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  33.79 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  29.45 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  29.45 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  29.45 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  30.15 
 
 
166 aa  72  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  29.24 
 
 
194 aa  72  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  30.82 
 
 
167 aa  72  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  30.14 
 
 
167 aa  72  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  30.82 
 
 
168 aa  72  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  30.14 
 
 
167 aa  72  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  30.14 
 
 
167 aa  72  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  30.82 
 
 
167 aa  72  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  31.47 
 
 
171 aa  72  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  29.33 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  30.14 
 
 
167 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  30.61 
 
 
171 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0336  30S ribosomal protein S5  28.97 
 
 
175 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000198476  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  31.76 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  28.87 
 
 
166 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  30.61 
 
 
171 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2996  30S ribosomal protein S5  30.61 
 
 
177 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.37992  normal  0.0218882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  30.14 
 
 
167 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  30.14 
 
 
167 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  30.32 
 
 
172 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  30.14 
 
 
167 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1144  ribosomal protein S5  31.21 
 
 
173 aa  71.2  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000788101  normal  0.0120151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  27.63 
 
 
172 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>