62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2031 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  100 
 
 		 640 aa  1315    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  79.94 
 
 		 614 aa  1027    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  64.88 
 
 		 583 aa  808    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  68.93 
 
 		 588 aa  768    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  62.76 
 
 		 644 aa  825    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0007  helicase c2  23.24 
 
 		 653 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000554419 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  29 
 
 		 466 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0015  helicase c2  27.08 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0747117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1524  helicase c2  25.61 
 
 		 657 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00208913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 773 aa  70.5  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  23.53 
 
 		 801 aa  68.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  25.83 
 
 		 807 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  26.41 
 
 		 798 aa  60.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.38 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  26.41 
 
 		 798 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  22.3 
 
 		 788 aa  57  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  23.43 
 
 		 575 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  34.31 
 
 		 749 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  21.95 
 
 		 574 aa  55.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  21.25 
 
 		 774 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  20.77 
 
 		 753 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.95 
 
 		 710 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  24.09 
 
 		 766 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.94 
 
 		 692 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  23.9 
 
 		 797 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.31 
 
 		 692 aa  51.6  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  29.28 
 
 		 790 aa  51.6  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  25 
 
 		 779 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  26.79 
 
 		 654 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.42 
 
 		 691 aa  52  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.41 
 
 		 711 aa  51.2  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  24.62 
 
 		 753 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  20.6 
 
 		 762 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  24.9 
 
 		 798 aa  50.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.86 
 
 		 690 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.27 
 
 		 690 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  23.04 
 
 		 669 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  21.73 
 
 		 758 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  21.8 
 
 		 772 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.27 
 
 		 690 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.5 
 
 		 690 aa  47.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  22.96 
 
 		 669 aa  47.8  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  28.4 
 
 		 723 aa  47.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.91 
 
 		 921 aa  47.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.27 
 
 		 690 aa  47.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.12 
 
 		 927 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.27 
 
 		 690 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  25.42 
 
 		 787 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  23.96 
 
 		 670 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  22.44 
 
 		 758 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.45 
 
 		 690 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.38 
 
 		 708 aa  45.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.25 
 
 		 691 aa  45.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.86 
 
 		 690 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.86 
 
 		 690 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.86 
 
 		 690 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.63 
 
 		 700 aa  44.3  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.81 
 
 		 691 aa  44.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  32 
 
 		 1067 aa  44.3  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.45 
 
 		 690 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  21.94 
 
 		 753 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  24.13 
 
 		 773 aa  43.9  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>