148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0988 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
253 aa  485  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  71.43 
 
 
253 aa  289  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  53.01 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.05 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  52.19 
 
 
253 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.94 
 
 
243 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.72 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.12 
 
 
271 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.88 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.8 
 
 
257 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.34 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.92 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.92 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.83 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.45 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.18 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.35 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.35 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.76 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.32 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.2 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.92 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  24.48 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.28 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.94 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.31 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  28.4 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.42 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.47 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.38 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.52 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.12 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.05 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.42 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.42 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.42 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.42 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  31.45 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.45 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.94 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.81 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  31.45 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.92 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  30.86 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.91 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  29.63 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.66 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  23.32 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  29.15 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  29.15 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.28 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  32.65 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  29.15 
 
 
247 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.78 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  29.15 
 
 
247 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.33 
 
 
282 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  29.1 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.92 
 
 
251 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.4 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.38 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  29.75 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.57 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  31.3 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.42 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.25 
 
 
262 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.14 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.34 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.73 
 
 
268 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.17 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.15 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.3 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  28.97 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.92 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.99 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.36 
 
 
302 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.58 
 
 
216 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.14 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.04 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.17 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.57 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.23 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.41 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
272 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.1 
 
 
266 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.92 
 
 
280 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.24 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.85 
 
 
268 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.31 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.57 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  33.33 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  25.78 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.85 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  31.1 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.13 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.15 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.7 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  27.57 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>