197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2712 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  46.37 
 
 		 172 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  44.38 
 
 		 175 aa  155  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  40.12 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  44.19 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  33.12 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  30.94 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  26.79 
 
 		 266 aa  67.8  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  28.48 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  28.07 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  28.95 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  30.26 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  35.87 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  34.78 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1622  cytochrome c oxidase, subunit II  29.09 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.93 
 
 		 316 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  38.55 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  26.04 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  28.46 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  32.08 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  29.28 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  26.37 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  30.7 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  26.71 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0103  hypothetical protein  31.54 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  28.42 
 
 		 302 aa  58.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  25.7 
 
 		 301 aa  57.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  32.38 
 
 		 321 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  37.68 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  33.66 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  34.48 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  31.11 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  35.29 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  26.57 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  29.94 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  32.99 
 
 		 329 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  29.81 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0480  cytochrome c oxidase, subunit II  33.7 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.671352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  30.43 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.54 
 
 		 370 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0183  cytochrome c oxidase subunit II  26.42 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 337 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 337 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  29.95 
 
 		 426 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  27.03 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  35.44 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  25.7 
 
 		 342 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  26.81 
 
 		 367 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  36.14 
 
 		 372 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  27.89 
 
 		 337 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  28.78 
 
 		 354 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  29.32 
 
 		 334 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 381 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  36.14 
 
 		 372 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  29.9 
 
 		 330 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 		 350 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.82 
 
 		 338 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 314 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 		 350 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 		 350 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  29.81 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  28.79 
 
 		 327 aa  51.2  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  37.33 
 
 		 260 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 		 256 aa  51.2  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  28.25 
 
 		 371 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  36.62 
 
 		 377 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  30.39 
 
 		 353 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.96 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  24.5 
 
 		 329 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.7 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  33.01 
 
 		 405 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  28.78 
 
 		 434 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  24.78 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  27.34 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  32.32 
 
 		 310 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  33.67 
 
 		 352 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 352 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 		 330 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 		 211 aa  48.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.73 
 
 		 274 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.94 
 
 		 324 aa  48.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 		 289 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  27.43 
 
 		 342 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  34.29 
 
 		 370 aa  47.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 321 aa  47.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  29.31 
 
 		 359 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  30.11 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 351 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 405 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>