264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4703 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 383 aa  739    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.79 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.66 
 
 		 380 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.67 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.06 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.4 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.74 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  21.33 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  21.98 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  24.08 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  24.93 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  17.49 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  20.75 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  24.08 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.38 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  17.4 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  18 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  20.16 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  20.16 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  20.16 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  20.16 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  22.66 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  16.94 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  16.71 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  21.05 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  21.94 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  21.88 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  19.58 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  22.37 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  19.68 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  21.53 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  19.89 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  20.25 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  19.75 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.44 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  18.27 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  22.64 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  18.16 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  19.21 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  18.87 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  21.81 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  19.73 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  23.66 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  19.58 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  20.16 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  21.77 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  18.88 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  18.65 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  20.43 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.31 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  19.89 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.15 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  19.59 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  18.88 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 430 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2899  hypothetical protein  21.2 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0941072  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.93 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  18.97 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.14 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  17.91 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  22.6 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>