67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2717 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 657 aa  1315    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  37.57 
 
 		 348 aa  148  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0361  Clp domain-containing protein  38.65 
 
 		 765 aa  123  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.722952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  25.61 
 
 		 396 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.3 
 
 		 1016 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  27.86 
 
 		 1844 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  26.91 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  30.03 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  25.94 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  30.03 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  28.36 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  29.45 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3830  WD-40 repeat protein  26.5 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171146  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  29.13 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  29.58 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.57 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  27.61 
 
 		 504 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 		 1711 aa  70.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  27.62 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.16 
 
 		 1196 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  26.5 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  28.2 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  29.44 
 
 		 652 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  27.43 
 
 		 383 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  26.57 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  27.09 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  26.14 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  26.29 
 
 		 404 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.65 
 
 		 1203 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.35 
 
 		 925 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  26.69 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  29.75 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.45 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.28 
 
 		 1760 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  23.5 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.45 
 
 		 501 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  26.86 
 
 		 384 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  24.71 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  25.71 
 
 		 330 aa  56.2  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  27.11 
 
 		 344 aa  55.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  30 
 
 		 438 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  23.78 
 
 		 494 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.79 
 
 		 477 aa  54.3  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  31.01 
 
 		 1510 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.26 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.26 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  28.93 
 
 		 401 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.45 
 
 		 1240 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.29 
 
 		 1557 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.8 
 
 		 1686 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.01 
 
 		 429 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.59 
 
 		 658 aa  51.2  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.61 
 
 		 466 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 393 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1553 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 		 322 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.85 
 
 		 795 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 		 1343 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.24 
 
 		 1004 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  25.84 
 
 		 770 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.85 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  27.33 
 
 		 318 aa  45.8  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  27.65 
 
 		 513 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5561  hypothetical protein  29.63 
 
 		 619 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.27855e-47 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  27.06 
 
 		 513 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  27.06 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>