More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2642 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 288 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  68.7 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  64.26 
 
 		 263 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  67.55 
 
 		 266 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  67.55 
 
 		 266 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  67.55 
 
 		 266 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  64.64 
 
 		 272 aa  344  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  62.21 
 
 		 266 aa  338  7e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  58.56 
 
 		 268 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  58.87 
 
 		 267 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  62.36 
 
 		 264 aa  332  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  56.44 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  52.45 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  52.83 
 
 		 274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  55.51 
 
 		 267 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  55.51 
 
 		 267 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  54.41 
 
 		 276 aa  299  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  52.09 
 
 		 269 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  51.29 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  53.38 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  49.25 
 
 		 270 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  54.02 
 
 		 281 aa  279  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  49.43 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  46.18 
 
 		 269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  46.74 
 
 		 268 aa  258  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  48.35 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  51.54 
 
 		 282 aa  247  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 287 aa  238  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  44.27 
 
 		 268 aa  215  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  35.98 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.09 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.4 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 259 aa  95.9  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.85 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29.48 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.3 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 345 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 360 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  26.88 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 		 260 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  27.84 
 
 		 262 aa  85.9  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.45 
 
 		 392 aa  85.9  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 266 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  25.83 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.94 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  27.59 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.55 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.04 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.1 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  23.44 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  23.44 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.31 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.54 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  25.46 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.86 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  27.64 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  25.39 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  28.31 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  26.27 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  28.79 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>