51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2093 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  614  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  34.67 
 
 
307 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  30.93 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  33.12 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  32.64 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  30.72 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  30.72 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  29.27 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  39.71 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  27.18 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  29.88 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  29.88 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  28.66 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  29.88 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  31.52 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  21.08 
 
 
314 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  29.33 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  32.74 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  28.86 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  33.13 
 
 
258 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  26.85 
 
 
315 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  26.74 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  28.77 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  27.27 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  27.45 
 
 
277 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  32.69 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  27.33 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  27.24 
 
 
234 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  38.71 
 
 
276 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  30.39 
 
 
302 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  25.82 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3914  hypothetical protein  30.5 
 
 
196 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520495  normal  0.0615465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  28.24 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  24.22 
 
 
257 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  25.95 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  25.09 
 
 
266 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4165  hypothetical protein  25 
 
 
369 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.381239  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  31.84 
 
 
343 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  25.34 
 
 
456 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  28.87 
 
 
279 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  23.61 
 
 
229 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  29.1 
 
 
265 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  22.42 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  32.76 
 
 
231 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0254  hypothetical protein  19.83 
 
 
400 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0611917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  28.67 
 
 
417 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  34.48 
 
 
283 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1364  hypothetical protein  32.56 
 
 
248 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.361689  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  27.56 
 
 
274 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  37.68 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>