277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2047 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2047  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
303 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.254802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5719  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5340  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5429  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6060  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.88 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  38.51 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  36.5 
 
 
275 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  31.1 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  38.94 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  36.28 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  38.05 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  38.05 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  33.64 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  34.51 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  28.86 
 
 
219 aa  59.3  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  31.88 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  24.9 
 
 
265 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  28.31 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
270 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  25 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  34.56 
 
 
276 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  25 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.58 
 
 
262 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  32.74 
 
 
239 aa  53.1  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  33.33 
 
 
294 aa  52.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  33.01 
 
 
259 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
256 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 
253 aa  52.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14941  Alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
302 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0521265  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
367 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11931  Alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
299 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0662  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.212326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  38.32 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  37.21 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  31.73 
 
 
257 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 
262 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  23.89 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
371 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  31.9 
 
 
247 aa  49.7  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1620  hypothetical protein  45.21 
 
 
257 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 
368 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  35.9 
 
 
350 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
265 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 
431 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  40.5 
 
 
272 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  32.35 
 
 
255 aa  49.3  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  32.35 
 
 
255 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.52 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  32.35 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  32.35 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  28.3 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7224  alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  31.62 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.58 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  29.3 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>