36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1481 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1481  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 427 aa  850    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  normal  0.39369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  54.94 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4907  transcriptional regulator, XRE family  48.36 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  25.99 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  24.49 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  27.62 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  26.18 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  24.89 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  25.68 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  26.26 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  27.91 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  23.98 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  22.6 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  29.79 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  26.33 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 530 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  25.79 
 
 		 526 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  29.94 
 
 		 579 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  22.98 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  27.09 
 
 		 440 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  27.66 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  28.35 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1281  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  26.76 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  25.12 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  27.01 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  27.36 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  23.26 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>