239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0333 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
274 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  68.98 
 
 
269 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  52.21 
 
 
275 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  47.45 
 
 
269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  49.27 
 
 
270 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.59 
 
 
274 aa  201  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  45.05 
 
 
276 aa  195  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.68 
 
 
271 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  40.66 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  41.24 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  43.21 
 
 
275 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  42.06 
 
 
274 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  41.24 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  43.12 
 
 
271 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  34.75 
 
 
275 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  38.29 
 
 
274 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  38.6 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  34.93 
 
 
271 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  36.13 
 
 
271 aa  149  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  36.72 
 
 
275 aa  148  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  37.92 
 
 
448 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  35.6 
 
 
271 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.6 
 
 
279 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.44 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  38.98 
 
 
290 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  35.51 
 
 
449 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  37.35 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
443 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
443 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
443 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.51 
 
 
446 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  40.88 
 
 
270 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  37.78 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.84 
 
 
445 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  31 
 
 
445 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  37.86 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.5 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.43 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.53 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.5 
 
 
178 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  30.47 
 
 
177 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
181 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  41.77 
 
 
157 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 
182 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.85 
 
 
182 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.03 
 
 
182 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.15 
 
 
182 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.78 
 
 
182 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.71 
 
 
182 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.88 
 
 
182 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.88 
 
 
182 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.5 
 
 
177 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  34.41 
 
 
135 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
180 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  40 
 
 
177 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.04 
 
 
175 aa  55.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
179 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
178 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
183 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.97 
 
 
177 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.97 
 
 
177 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.97 
 
 
177 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.27 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.67 
 
 
178 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.97 
 
 
177 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.75 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.67 
 
 
178 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.25 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.84 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.97 
 
 
177 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.4 
 
 
177 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.4 
 
 
177 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  25.81 
 
 
182 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 
180 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.15 
 
 
180 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  41.54 
 
 
158 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.4 
 
 
177 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.25 
 
 
177 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03619  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.6 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00523657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4232  ATP synthase F1, delta subunit  29.6 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03563  hypothetical protein  29.6 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00259121  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4186  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.6 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000191061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4251  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.6 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4259  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.6 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000372939  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5171  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.6 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00189703  decreased coverage  0.00512499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3951  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.6 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000356722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.6 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00374645  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.32 
 
 
180 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.32 
 
 
180 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  38.67 
 
 
178 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.67 
 
 
178 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.6 
 
 
177 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.32 
 
 
180 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.08 
 
 
179 aa  52  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.33 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  40 
 
 
158 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.67 
 
 
177 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>