More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1844 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1844  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 		 414 aa  833    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.521996  normal  0.198003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  60.57 
 
 		 701 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  60.29 
 
 		 703 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  58.86 
 
 		 706 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  57.43 
 
 		 704 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  55.03 
 
 		 673 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  58.57 
 
 		 1537 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  56.66 
 
 		 721 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  57.06 
 
 		 709 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  57.43 
 
 		 730 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  57.71 
 
 		 712 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  56.57 
 
 		 720 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  55.14 
 
 		 720 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  54.83 
 
 		 706 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  56 
 
 		 701 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  54.13 
 
 		 714 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  54.13 
 
 		 714 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  53.67 
 
 		 718 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  54.29 
 
 		 751 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  53.5 
 
 		 733 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  54.13 
 
 		 714 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  53.93 
 
 		 726 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  54.9 
 
 		 707 aa  388  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  54.24 
 
 		 723 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  54.57 
 
 		 707 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  55.71 
 
 		 701 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  54.86 
 
 		 720 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  54.29 
 
 		 752 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  56.29 
 
 		 713 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  52.41 
 
 		 706 aa  382  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  55.14 
 
 		 776 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  53.67 
 
 		 708 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  53.14 
 
 		 779 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  52.69 
 
 		 709 aa  377  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  52.09 
 
 		 711 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  55.62 
 
 		 720 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  55.37 
 
 		 721 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  50.56 
 
 		 722 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  55.62 
 
 		 722 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  50.42 
 
 		 710 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  52.09 
 
 		 711 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  55.62 
 
 		 720 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  55.24 
 
 		 721 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  51.36 
 
 		 733 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  53.71 
 
 		 708 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  50.88 
 
 		 730 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  54.49 
 
 		 712 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  52.81 
 
 		 720 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  55.18 
 
 		 700 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  53.93 
 
 		 714 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  53.37 
 
 		 715 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  51.04 
 
 		 830 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  52.96 
 
 		 711 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  53.8 
 
 		 722 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  53.09 
 
 		 712 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  51.69 
 
 		 788 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  50.97 
 
 		 716 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  50.29 
 
 		 730 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  52.81 
 
 		 712 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  51.27 
 
 		 729 aa  356  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  48.01 
 
 		 802 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  52.26 
 
 		 709 aa  353  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  50.28 
 
 		 710 aa  352  7e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  48.45 
 
 		 721 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  51.54 
 
 		 711 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1486  glycogen debranching enzyme GlgX  50.56 
 
 		 705 aa  348  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  52.94 
 
 		 715 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  49.45 
 
 		 750 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  47.78 
 
 		 719 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  49.43 
 
 		 727 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  50.14 
 
 		 752 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  52.42 
 
 		 698 aa  346  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  50.84 
 
 		 712 aa  346  4e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  49.43 
 
 		 694 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  50.14 
 
 		 752 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  50.14 
 
 		 691 aa  346  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  49.86 
 
 		 752 aa  346  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  53.08 
 
 		 718 aa  345  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  49.14 
 
 		 694 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  50.27 
 
 		 733 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  53.8 
 
 		 718 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  49.73 
 
 		 733 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  50.7 
 
 		 688 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  50.27 
 
 		 733 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  46.65 
 
 		 718 aa  341  1e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  49.73 
 
 		 733 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  49.14 
 
 		 691 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  48.3 
 
 		 701 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  52.16 
 
 		 701 aa  339  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  49.01 
 
 		 723 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  47.44 
 
 		 758 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  47.44 
 
 		 758 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  47.16 
 
 		 755 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  48.76 
 
 		 735 aa  336  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  49.86 
 
 		 688 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  49.86 
 
 		 688 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  48.03 
 
 		 1464 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  49.15 
 
 		 757 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0515  glycogen debranching protein GlgX  50.57 
 
 		 739 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  51.55 
 
 		 704 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>