More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0840 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 152 aa  317  3e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  66.45 
 
 		 152 aa  233  5.0000000000000005e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  64.47 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  65.13 
 
 		 156 aa  224  3e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  61.18 
 
 		 187 aa  208  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  60.78 
 
 		 154 aa  197  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  54.67 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  59.33 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  56.58 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  59.33 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  55.92 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 		 154 aa  183  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  54.3 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  54.3 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  56.58 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  55.92 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  53.64 
 
 		 154 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  56.58 
 
 		 153 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 		 154 aa  180  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  53.02 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  58.55 
 
 		 152 aa  180  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  58 
 
 		 153 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  53.95 
 
 		 153 aa  177  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  52.35 
 
 		 160 aa  176  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  57.33 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  53.29 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  56.67 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 159 aa  174  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  55.33 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 152 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  55.26 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  51.97 
 
 		 154 aa  170  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  51.97 
 
 		 154 aa  170  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  48.99 
 
 		 159 aa  166  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  55.64 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  44.74 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  49.3 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  53.24 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  53.62 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  48.28 
 
 		 147 aa  153  9e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  48.97 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  50.69 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  47.52 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  52.03 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  52.9 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  47.95 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  51.45 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 		 145 aa  150  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  50.68 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  46.85 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  52.55 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  46.21 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  51.37 
 
 		 147 aa  147  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  48.95 
 
 		 142 aa  147  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  50 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  46.48 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  48.98 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  46.9 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  50 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  47.55 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  46.9 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>