61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_21151 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 342 aa  678    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  96.49 
 
 		 342 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  50.15 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  48.95 
 
 		 321 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  55.09 
 
 		 335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  48.35 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  38.1 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  38.81 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  37.5 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  36.9 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  33.43 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  33.43 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  33.53 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  32.4 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  30.29 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  30.13 
 
 		 328 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  28.44 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  31.9 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  30.53 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  27.87 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  28.31 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  23.36 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.6 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  22.05 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.45 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  21.71 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.24 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.62 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  20.19 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  21.36 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  22.54 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  21.72 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  21.89 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  21.28 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.42 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  22.66 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  20.85 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.75 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.49 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  22.32 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  23.05 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  20.92 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22.57 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  23.55 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  21.99 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  24.25 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  22.87 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  22.87 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  18.89 
 
 		 345 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  23.53 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.54 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  20.51 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 324 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 324 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  21.53 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  20.51 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  22.36 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  22.09 
 
 		 354 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>