More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5732 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
278 aa  544  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.97 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  27.24 
 
 
262 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
268 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  31.72 
 
 
265 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
264 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  32.62 
 
 
265 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
264 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
264 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.86 
 
 
265 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  28.79 
 
 
262 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  32.19 
 
 
265 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  32.9 
 
 
263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
263 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
259 aa  109  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 
259 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  31.8 
 
 
252 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 
259 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  35.18 
 
 
283 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
258 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
258 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.73 
 
 
260 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
262 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
259 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
267 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
260 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
259 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 
261 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 
262 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
258 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
262 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
574 aa  97.8  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  27.27 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
287 aa  89.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
268 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  30.34 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
271 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  25.54 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  25.54 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  25.54 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  25.54 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  26.01 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  25.56 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1236  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.42 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362839  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154787  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.58 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.89 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747095  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  29.72 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  25.1 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  26.46 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0488  ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.16 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.32 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000222411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.607638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.57 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326654  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
593 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2153  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.16 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.70472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  25.71 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.15 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.466236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.98 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1389  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.95 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  25.71 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  25.71 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  25.71 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  25.71 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1072  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  28.38 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.465814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>