103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5727 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5727  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1090  putative PAS/PAC sensor protein  69.16 
 
 		 228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5113  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  63.51 
 
 		 223 aa  274  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5202  putative PAS/PAC sensor protein  63.51 
 
 		 223 aa  274  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5493  putative PAS/PAC sensor protein  63.51 
 
 		 223 aa  274  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  50.93 
 
 		 222 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  50.93 
 
 		 222 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  50.93 
 
 		 222 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4425  putative PAS/PAC sensor protein  52.48 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  50.7 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3447  putative PAS/PAC sensor protein  52.02 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.509002  normal  0.758938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1618  PAS fold-3  55.2 
 
 		 145 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1643  putative PAS/PAC sensor protein  55.2 
 
 		 145 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  39.44 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1589  putative PAS/PAC sensor protein  53.33 
 
 		 144 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11970  RNA-binding protein with PAS domain  39.18 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.494422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1401  putative PAS/PAC sensor protein  37.43 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0100  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.43 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3029  putative PAS/PAC sensor protein  34.59 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  32.75 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3244  putative PAS/PAC sensor protein  30.94 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1403  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.18 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.478088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  29.48 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0560  putative PAS/PAC sensor protein  25.99 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.23 
 
 		 1514 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.23 
 
 		 1514 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.37 
 
 		 958 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1596 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.13 
 
 		 572 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  57.69 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  30.77 
 
 		 872 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4878  PAS fold-3 domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1288  sensory box protein  25.96 
 
 		 685 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 1562 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 897 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 695 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.85 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 1016 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 1669 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54.17 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0732  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.32 
 
 		 446 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1148 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 918 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32 
 
 		 954 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 1273 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 1111 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 1069 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  30.39 
 
 		 536 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.22 
 
 		 1202 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  28.57 
 
 		 1041 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 1124 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 1002 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 3706 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 785 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 1300 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 688 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 		 1965 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3414  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 		 673 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 921 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0529  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.13 
 
 		 575 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.81 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 1253 aa  45.1  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1303  transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 		 442 aa  45.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 1714 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  29.73 
 
 		 728 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  25.51 
 
 		 1089 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  45.65 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  47.73 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3508  diguanylate cyclase  27.94 
 
 		 358 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00123099  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 896 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  51.11 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3063  diguanylate cyclase  29.63 
 
 		 1003 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3287  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.53 
 
 		 1003 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 		 1432 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  24.64 
 
 		 499 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  46.81 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0132  PAS domain-containing protein  29.85 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.272922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 1120 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  44.68 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.58 
 
 		 865 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 		 1116 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  46.81 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5399  PAS sensor protein  26.21 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 		 1350 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 922 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  26.03 
 
 		 1099 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.62 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.62 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.62 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 942 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 1501 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 712 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1182 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  48.89 
 
 		 249 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  29.52 
 
 		 1125 aa  42  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 1125 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1009 aa  41.6  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0144  putative PAS/PAC sensor protein  22.41 
 
 		 433 aa  41.6  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>