More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1978 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  85.52 
 
 		 222 aa  380  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  72.97 
 
 		 222 aa  327  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  72.97 
 
 		 222 aa  327  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  72.97 
 
 		 222 aa  327  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  50.22 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  43.72 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  37.5 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  38.32 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  33.64 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10166  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  32.73 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 235 aa  98.2  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 228 aa  88.2  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 228 aa  88.2  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 229 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.63 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  29.35 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  27.06 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  31.16 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>