More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10166 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10166  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  72.37 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  72.37 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  72.37 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  63.01 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  68.59 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  55.49 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  52.2 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  49.07 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  36.67 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  37.09 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  35.66 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  31.91 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  42.73 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  31.89 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 223 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 223 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 223 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 223 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  37.09 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  29.19 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.87 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>