More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1456 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  67.42 
 
 		 227 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  67.43 
 
 		 227 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  55.56 
 
 		 232 aa  254  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.07 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.07 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.07 
 
 		 232 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  53.57 
 
 		 232 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.07 
 
 		 232 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  54.02 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  52.25 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  51.56 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  51.15 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  51.35 
 
 		 227 aa  241  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.68 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  50.88 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 232 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 230 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  51.35 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.78 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.15 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  54.82 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  50 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  56.85 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.48 
 
 		 235 aa  232  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.98 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.98 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.98 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.98 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.98 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  46.98 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  46.98 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.98 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  48.26 
 
 		 231 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 228 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  53.37 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.09 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.74 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.78 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.05 
 
 		 235 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  49.77 
 
 		 223 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.16 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  53.64 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.78 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.78 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.14 
 
 		 242 aa  228  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.13 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48 
 
 		 229 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.13 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 231 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.95 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  53.85 
 
 		 238 aa  227  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  48.62 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 227 aa  227  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  52.89 
 
 		 228 aa  227  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.12 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  49.55 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 238 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  49.1 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.84 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 224 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  50 
 
 		 225 aa  225  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 224 aa  225  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  50 
 
 		 225 aa  225  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 224 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  52.25 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.67 
 
 		 242 aa  225  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  51.35 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  51.82 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.47 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  50.67 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  47.19 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>