More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2049 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2049  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 289 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2821  polyprenyl synthetase  62.32 
 
 		 289 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230179  normal  0.537007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2727  polyprenyl synthetase  62.32 
 
 		 288 aa  298  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0712991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3694  polyprenyl synthetase  62.28 
 
 		 290 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.816897  hitchhiker  0.00301236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2849  Polyprenyl synthetase  62.68 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2983  farnesyl-diphosphate synthase  59.52 
 
 		 289 aa  295  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2954  Polyprenyl synthetase  61.27 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0123408  normal  0.0660795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6440  farnesyl-diphosphate synthase  56.14 
 
 		 289 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1707  Polyprenyl synthetase  55.63 
 
 		 288 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1290  polyprenyl synthetase  55.71 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1613  polyprenyl synthetase  57.04 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1909  polyprenyl synthetase  52.63 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0962884  normal  0.361661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4004  polyprenyl synthetase  55.36 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  hitchhiker  0.00057094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0265  farnesyl-diphosphate synthase  52.26 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2039  polyprenyl synthetase  51.5 
 
 		 288 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.678987  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3759  polyprenyl synthetase  53.98 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3514  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  50.18 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0182  farnesyl-diphosphate synthase  49.09 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  40.23 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  41.03 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  44.04 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  37.21 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  36.84 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  38.74 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  41.15 
 
 		 337 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  37.64 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  39.33 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  35.08 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  38.3 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  38.68 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  38.08 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  44.86 
 
 		 290 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  40.25 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  37.1 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  40.91 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  33.46 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  38.28 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  39.74 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  41.34 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  39.33 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  41.13 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  36.69 
 
 		 300 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  39.48 
 
 		 327 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  36.91 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  38.02 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  36.91 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  39.13 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  38.49 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  40.65 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  39.13 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  42.29 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  38.74 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  33.95 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  39.02 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  39.38 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  34.96 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  35.11 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2876  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  36.48 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  40.08 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  39.02 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  39.02 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  39.02 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  39.75 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  35.93 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  36.14 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  33.95 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  34.41 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  39.75 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  34.85 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  38.56 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  31.68 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  40.64 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  31.93 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0955  Polyprenyl synthetase  41.2 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  35.06 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  38.49 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  40.98 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  34.69 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  30.43 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  40.93 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  36.63 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  37.08 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0787  polyprenyl synthetase  31.4 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.491944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>