249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1480 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  65.75 
 
 
256 aa  308  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.2 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  62.45 
 
 
263 aa  291  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.17 
 
 
257 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.31 
 
 
259 aa  266  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.57 
 
 
257 aa  248  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2010  4-oxalocrotonate decarboxylase  59.27 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.01 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.25 
 
 
254 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.4 
 
 
255 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.16 
 
 
261 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.41 
 
 
257 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3899  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.62 
 
 
257 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.553446 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.21 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  47.79 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  42.13 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  43.02 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.2 
 
 
262 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.36 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.13 
 
 
264 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.43 
 
 
262 aa  174  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  40.87 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.16 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  40.64 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.65 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.67 
 
 
261 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.74 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.08 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.58 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.6 
 
 
261 aa  158  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.43 
 
 
262 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  36.51 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.53 
 
 
267 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.58 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.74 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.22 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.7 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  35.86 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.34 
 
 
263 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.27 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  34.75 
 
 
260 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.4 
 
 
260 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.08 
 
 
261 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.11 
 
 
263 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.11 
 
 
263 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.27 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  32.94 
 
 
262 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.51 
 
 
260 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.43 
 
 
261 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.08 
 
 
264 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.47 
 
 
262 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.56 
 
 
280 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.35 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.78 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.35 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.75 
 
 
260 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.3 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  35.19 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.66 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.89 
 
 
259 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.19 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.33 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.24 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.6 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  40 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.6 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.89 
 
 
259 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.76 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.06 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.62 
 
 
262 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.33 
 
 
273 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.16 
 
 
261 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.55 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.55 
 
 
265 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.97 
 
 
261 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  38.29 
 
 
264 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.98 
 
 
260 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 
274 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 
274 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.61 
 
 
265 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  33.88 
 
 
255 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  29.57 
 
 
265 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.1 
 
 
265 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.3 
 
 
267 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.33 
 
 
276 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.86 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.98 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.06 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  33.88 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  35.87 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.1 
 
 
261 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.14 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.43 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.61 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  33.77 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.32 
 
 
261 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.6 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.33 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.11 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>