More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2038 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  71.21 
 
 		 265 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  56.61 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  54.39 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  47.35 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  51.93 
 
 		 248 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  46.91 
 
 		 245 aa  208  7e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  48.91 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  51.53 
 
 		 247 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  45.38 
 
 		 244 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  49.32 
 
 		 269 aa  200  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  47.62 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  50.84 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  48.93 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  45.99 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  52.17 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  46.22 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  48.07 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  49.15 
 
 		 260 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  46.78 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  46.78 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  44.39 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  43.09 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  45.3 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  45.45 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  49.36 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  47.19 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  44.77 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  43.16 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  43.16 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  40.09 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  43.16 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  43.53 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  43.62 
 
 		 264 aa  178  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  44.09 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  42.79 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  43.39 
 
 		 258 aa  174  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  42.49 
 
 		 241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  41.63 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  40.53 
 
 		 306 aa  172  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  42.49 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  40.16 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  45.59 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  44.34 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  47.22 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  42.38 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  43.06 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  43.87 
 
 		 276 aa  168  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  44.55 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  43.87 
 
 		 276 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  41.55 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  42.06 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  43.35 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  41.32 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  41.63 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  43.87 
 
 		 273 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  43.87 
 
 		 273 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  43.87 
 
 		 273 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  43.87 
 
 		 273 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  43.16 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  43.87 
 
 		 273 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  44.09 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  41.85 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  45.1 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  44.13 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  40.45 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  45.83 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  42.72 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1652  NAD-dependent deacetylase  43.4 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  40.49 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  40.77 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  40.77 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  40.34 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  41.51 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  41.51 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  41.51 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  41.51 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  41.51 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  41.51 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  41.51 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  41.18 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  40.28 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  41.04 
 
 		 273 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  40.34 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  39.92 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  43.14 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  37.9 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  40.28 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  43.14 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  43.14 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  39.81 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  42.65 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  42.54 
 
 		 260 aa  154  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  39.39 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  39.72 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>