105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1509 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1695  recombination regulator RecX  58.44 
 
 		 79 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00199497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  35.25 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  36.8 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1693  hypothetical protein  57.63 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00217946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  31.58 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  34.31 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  26.17 
 
 		 220 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  36.11 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  37.6 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  32.64 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  32.31 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  32.12 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  43.68 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.68 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  34.92 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  36.19 
 
 		 253 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  41.38 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  35 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  25.34 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  33.33 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0228  regulatory protein RecX  28.67 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  31.58 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  30.77 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  33.86 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  35.11 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1595  regulatory protein RecX  29.86 
 
 		 269 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  30.77 
 
 		 166 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  30.77 
 
 		 166 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  44.44 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  33.93 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2970  regulatory protein RecX  27.97 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  30.13 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  30.82 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  44.44 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  44.44 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  28.67 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  30.47 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  28.46 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  36.3 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  30.71 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3210  regulatory protein RecX  25.87 
 
 		 269 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.886971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  30.13 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1433  recombination regulator RecX  33.1 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.130729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  30.57 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  30.38 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  30.38 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  30.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  30.38 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  30.38 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  30.38 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  30.38 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  30.38 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  30.38 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  25.93 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  27.54 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  30.71 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  29.58 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  29.11 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  29.13 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  21.64 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  28.81 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  31.58 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  30.28 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  27.54 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  31.62 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  27.93 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  30.53 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  43.48 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  25.78 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  31.5 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  31.5 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  34.09 
 
 		 225 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  25.78 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25.76 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  30 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  26.81 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  29.32 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  37.21 
 
 		 257 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  29.37 
 
 		 155 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  30.43 
 
 		 150 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  33.75 
 
 		 163 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  30.66 
 
 		 160 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  26.36 
 
 		 159 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  30.53 
 
 		 168 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  30.66 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  31.4 
 
 		 264 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  36.78 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  28.77 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  32.81 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>