138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5035 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 402 aa  774    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  78.68 
 
 		 403 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  77.42 
 
 		 408 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  78.42 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  74.52 
 
 		 395 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  44.42 
 
 		 407 aa  285  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  42.96 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.49 
 
 		 431 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 		 440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.22 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.16 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  27.37 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  20.48 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  26.95 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.37 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  26.55 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  21.11 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  30.46 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  18.18 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  24.08 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 241 aa  53.5  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  24.88 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 383 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  21.9 
 
 		 376 aa  53.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  21.89 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  27.89 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.75 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.94 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.36 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  24.29 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  30.16 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  28.31 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  27.22 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  25.16 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  27.05 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  21.97 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 365 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  24.35 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  21.19 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 		 260 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  23.33 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  19.9 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  26.11 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  23.59 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  21.86 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  26.11 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  22.92 
 
 		 252 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  30.07 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  23.66 
 
 		 242 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 373 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 373 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 391 aa  47  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  30.77 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>