More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4829 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  100 
 
 
384 aa  770    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  57.87 
 
 
384 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  53.66 
 
 
386 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  53.37 
 
 
385 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  53.52 
 
 
385 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  53 
 
 
385 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  49.47 
 
 
388 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  52.25 
 
 
388 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.95 
 
 
396 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.68 
 
 
396 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 
397 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.55 
 
 
396 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  51.32 
 
 
388 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.41 
 
 
396 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  52.65 
 
 
399 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  52.94 
 
 
389 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  51.06 
 
 
389 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  50.66 
 
 
390 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.09 
 
 
397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  49.87 
 
 
379 aa  362  9e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  48.27 
 
 
389 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  52.39 
 
 
412 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  51.57 
 
 
382 aa  359  4e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  49.6 
 
 
387 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  48.28 
 
 
397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  50.4 
 
 
387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  50.26 
 
 
387 aa  355  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.59 
 
 
404 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  48.14 
 
 
403 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  52.11 
 
 
388 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  49.61 
 
 
387 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.48 
 
 
398 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  50.52 
 
 
389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  48.28 
 
 
387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  48.29 
 
 
402 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  48 
 
 
399 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  51.59 
 
 
391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  49.87 
 
 
396 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  49.87 
 
 
396 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  48.95 
 
 
387 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  49.87 
 
 
396 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  49.87 
 
 
396 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  49.87 
 
 
396 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.87 
 
 
403 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  49.87 
 
 
396 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  52.21 
 
 
385 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  49.87 
 
 
396 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  50.4 
 
 
396 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  47.48 
 
 
423 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  48.29 
 
 
387 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  52.29 
 
 
395 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  47.94 
 
 
425 aa  349  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.51 
 
 
398 aa  349  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  52.29 
 
 
395 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.19 
 
 
394 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.19 
 
 
394 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.19 
 
 
394 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  52.29 
 
 
395 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  49.08 
 
 
387 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  49.09 
 
 
396 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  49.21 
 
 
387 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  48.03 
 
 
387 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  48.79 
 
 
394 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  49.61 
 
 
391 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  49.6 
 
 
394 aa  345  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  51.34 
 
 
389 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.52 
 
 
394 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.83 
 
 
415 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  52.91 
 
 
390 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0512  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 
379 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  49.21 
 
 
387 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.83 
 
 
415 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.83 
 
 
399 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  49.21 
 
 
387 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.94 
 
 
388 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  50 
 
 
387 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  49.46 
 
 
396 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.83 
 
 
396 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  50 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  48.04 
 
 
401 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 
388 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  48.7 
 
 
394 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 
390 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  52.79 
 
 
388 aa  342  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  50.27 
 
 
389 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  52.09 
 
 
388 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  51.09 
 
 
395 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  49.73 
 
 
389 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  48.94 
 
 
394 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  48.94 
 
 
394 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  50.13 
 
 
391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  50.82 
 
 
395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  48.83 
 
 
397 aa  339  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  50.39 
 
 
389 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  48.45 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.27 
 
 
406 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  53.17 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  47.2 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.97 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>