More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3213 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 234 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  35.64 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 227 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  36.74 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 234 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  33.67 
 
 		 231 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 228 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 228 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 240 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  30.14 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 228 aa  99.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  99.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 238 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 227 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 225 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 233 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 229 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 230 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 222 aa  92.8  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 232 aa  92.4  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 232 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 231 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 230 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 227 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 239 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 228 aa  89  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 241 aa  89  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 223 aa  88.6  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  25.33 
 
 		 225 aa  86.3  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 262 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 219 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 226 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>