157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2013 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1056    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.46 
 
 		 548 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  35.41 
 
 		 471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  33.64 
 
 		 471 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  33.57 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  35.56 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  37.03 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  34.55 
 
 		 483 aa  226  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  36.12 
 
 		 488 aa  225  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  31.16 
 
 		 500 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  34.05 
 
 		 486 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  34.67 
 
 		 477 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  45.58 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  45.38 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  41.88 
 
 		 499 aa  209  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  45.45 
 
 		 500 aa  206  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  42.55 
 
 		 525 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  41.51 
 
 		 507 aa  203  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  35.86 
 
 		 472 aa  203  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  41.04 
 
 		 507 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  46.43 
 
 		 467 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  33.63 
 
 		 477 aa  198  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.53 
 
 		 499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  40.62 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  40.58 
 
 		 474 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  46.41 
 
 		 471 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  36.02 
 
 		 534 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  38.69 
 
 		 522 aa  174  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  33.64 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  36.3 
 
 		 536 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  36.46 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  36.87 
 
 		 503 aa  170  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  36 
 
 		 534 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  36.97 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  38.51 
 
 		 465 aa  167  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  37.27 
 
 		 545 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  35.34 
 
 		 489 aa  166  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  37.18 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  36.41 
 
 		 472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  34.63 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  36.87 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  35 
 
 		 552 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  38.54 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  35.77 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  35.79 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.16 
 
 		 503 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  32.02 
 
 		 529 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.1 
 
 		 499 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  37.26 
 
 		 488 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  35.67 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.68 
 
 		 473 aa  96.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  94  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  28.73 
 
 		 473 aa  87  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  25.4 
 
 		 589 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  28.67 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  25.96 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  31.33 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  24.18 
 
 		 593 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  31.02 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  30.45 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  28.25 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  30.53 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  29.29 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  29.67 
 
 		 528 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  29.97 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  30.82 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  31.88 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.38 
 
 		 527 aa  61.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  31.75 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  27.71 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  27.27 
 
 		 440 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  30.8 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  27.32 
 
 		 470 aa  57  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  29.46 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.15 
 
 		 484 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  30.88 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  22.17 
 
 		 506 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  28.34 
 
 		 491 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2249  hypothetical protein  29.23 
 
 		 569 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732725  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  24.28 
 
 		 487 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  29.19 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  29.45 
 
 		 471 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  30.1 
 
 		 419 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  26.91 
 
 		 472 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  29.32 
 
 		 491 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  29.32 
 
 		 491 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 420 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  35 
 
 		 528 aa  53.9  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  45 
 
 		 469 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  28.66 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  28.66 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  27 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  28.66 
 
 		 491 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  26.84 
 
 		 356 aa  52.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  29.32 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  21.43 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  27.7 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  34.78 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1864  hypothetical protein  25.95 
 
 		 763 aa  52  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  25.83 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>