More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4729 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 385 aa  787    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  55.01 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  55.01 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  52.14 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  43.44 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  44.74 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  42.03 
 
 		 374 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 		 468 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  32.45 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  31.86 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  32.66 
 
 		 435 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  30.35 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 357 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 372 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  28.53 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.63 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  26.98 
 
 		 369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  26.32 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 667 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  25.44 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  24.64 
 
 		 343 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  30.3 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  27.46 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 328 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  30.55 
 
 		 667 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  25.61 
 
 		 330 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 667 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 		 335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.84 
 
 		 328 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.84 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.92 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.57 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  24.7 
 
 		 328 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.74 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  25.38 
 
 		 328 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 667 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.27 
 
 		 335 aa  96.7  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 363 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 344 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26.56 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  25.69 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 322 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  27.97 
 
 		 372 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 372 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  29.24 
 
 		 358 aa  93.2  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.81 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  27.45 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.16 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.5 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  26.95 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>