More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0095 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  65.32 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  56.64 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  55.83 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  57.39 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  61.79 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  61.79 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  55.36 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  59.65 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  49.52 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  46.79 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  43.36 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  48.62 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  41.46 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  44.54 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  55.68 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  49.5 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  42.11 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  47.47 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  42.2 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 127 aa  90.5  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 182 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 		 688 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 126 aa  84.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  42.11 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  41.07 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 177 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  37.61 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  40.95 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0711  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  33.04 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  45.35 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 1036 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  35.29 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 696 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  35.54 
 
 		 754 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  38.79 
 
 		 194 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 173 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  32.43 
 
 		 695 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  40 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 695 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1076 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 618 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  37.5 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 741 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1013 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 740 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  46.58 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  36.97 
 
 		 507 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 943 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1053 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  39.66 
 
 		 949 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  38.39 
 
 		 580 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 949 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  38.39 
 
 		 685 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 		 673 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  39.17 
 
 		 1036 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 699 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  39.52 
 
 		 573 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>