173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1588 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  335  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  38.46 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  44.35 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  37.5 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  38.97 
 
 		 149 aa  84.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 132 aa  84  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  44.55 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  36.23 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  43.09 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  43.36 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  46.72 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  50.91 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  50.91 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  37.98 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  40.17 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  36.23 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  38.52 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  44.74 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  34.09 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  36.23 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  39.13 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  38.81 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  32.64 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  37.01 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.39 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  39.44 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  36.5 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  41.03 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  38.73 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  36.17 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  41.9 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  37.04 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  34.81 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  36.52 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  32.86 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  40.52 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  40.52 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  40.52 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  33.95 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  34.43 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  38.24 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  40.2 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  36.36 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  40.2 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  34.17 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  40.2 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  40.2 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  40.2 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  40.2 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  40.2 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  37.07 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  35.29 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  38.1 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  39.29 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  32.79 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.08 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  38.74 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  35.77 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  44.54 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  30.94 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  33.09 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  38.74 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  37.27 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  34.4 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  39.13 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  36.11 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  32.5 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  37.74 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  34.48 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  30.43 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  30.43 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  35.65 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  40.4 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  37.8 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  35.61 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  46.08 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  32.1 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  31.88 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  36.11 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  35.65 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  46.23 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  32.62 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  30.33 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  38.06 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  34.48 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  30 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  35.61 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  35.61 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  32.14 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  31.9 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  33.54 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  36.72 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  36.5 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  36.5 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>