More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0237 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  100 
 
 		 205 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  59.79 
 
 		 193 aa  235  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  69.48 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  67.5 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  69.43 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  68.59 
 
 		 189 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  66.67 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  57.3 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  66.24 
 
 		 213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  64.9 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  57.14 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  66.01 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  61.15 
 
 		 233 aa  207  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  58.39 
 
 		 231 aa  207  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  58.86 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  53.41 
 
 		 185 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  52.25 
 
 		 192 aa  184  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  63.43 
 
 		 151 aa  181  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  56.76 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  58.91 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  52.78 
 
 		 158 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 184 aa  158  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  51.41 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  46.24 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  48.19 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  48.19 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  54.01 
 
 		 158 aa  154  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  45.05 
 
 		 184 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  46.96 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  48.41 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  44.89 
 
 		 179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  45.7 
 
 		 173 aa  151  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  45.09 
 
 		 183 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  44.57 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  52.78 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  42 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  43.24 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  44.57 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  43.24 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  52.14 
 
 		 161 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 160 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 160 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 160 aa  148  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 160 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  49.32 
 
 		 162 aa  148  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  46.43 
 
 		 158 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  43.93 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 164 aa  147  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  53.24 
 
 		 160 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  43.6 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  47.3 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  51.03 
 
 		 161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  48.28 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  44.51 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  48.97 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  48.97 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  55.24 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  44 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  48.97 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  48.97 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  52.52 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  51.43 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  47.62 
 
 		 158 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  50 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  50 
 
 		 153 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  50 
 
 		 159 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 161 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  45.62 
 
 		 160 aa  144  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  44.38 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  43.27 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  54.62 
 
 		 168 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  48.65 
 
 		 162 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  47.17 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  51.11 
 
 		 160 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  43.27 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  43.27 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  47.97 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  47.02 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  43.37 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  51.49 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  43.45 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  45.27 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 161 aa  141  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  47.62 
 
 		 159 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>