126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2376 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  100 
 
 		 289 aa  593  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  70.83 
 
 		 289 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  73.08 
 
 		 289 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  64.36 
 
 		 290 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  64.01 
 
 		 289 aa  361  8e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  40.33 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  39.14 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  40.85 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  33.74 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  33.93 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  35.57 
 
 		 328 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  36.19 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  36.25 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  35.35 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  36.39 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  35.81 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  31.21 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  31.16 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  30.92 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  30.36 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  31.62 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  28.78 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  28.78 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  32.29 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  29.77 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  29.08 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  29.68 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  30.86 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  30.11 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  31.97 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  26.69 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  28.32 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  33.8 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  29.56 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  31.14 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  27.44 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  28.93 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  30.77 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  30 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  29.93 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  29.25 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  31.74 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  29.04 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  29.92 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  25.81 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  30.49 
 
 		 735 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  24.58 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  31.02 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  31.02 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  28.85 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  27.69 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  27.78 
 
 		 356 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  26.42 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  29.26 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  24.64 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  25.7 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  27.16 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  25.98 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  28.11 
 
 		 900 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25.28 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  25 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  24.12 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  28.06 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  26.4 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  25.48 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  25.22 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  27.11 
 
 		 490 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  28.36 
 
 		 401 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  24.87 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  26.53 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  29.1 
 
 		 412 aa  52.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  26.9 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  24.32 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  24.86 
 
 		 389 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  24.62 
 
 		 404 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  23.94 
 
 		 370 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  27.23 
 
 		 339 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  21.78 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  22.02 
 
 		 380 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  29.08 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  27.05 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  33.33 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  29.31 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  25.38 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  23.24 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  21.13 
 
 		 383 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  21.13 
 
 		 383 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  21.13 
 
 		 383 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  25.9 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  25.26 
 
 		 414 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  22.32 
 
 		 383 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  24.09 
 
 		 391 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  27.75 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31076  predicted protein  44.07 
 
 		 488 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  22.29 
 
 		 391 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  21.47 
 
 		 351 aa  46.2  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04957  galactokinase (AFU_orthologue; AFUA_3G10300)  28.41 
 
 		 524 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  25.1 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  24.32 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  23.14 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>