117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6950 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  100 
 
 
587 aa  1145    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  29.8 
 
 
584 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  29.8 
 
 
584 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  34.54 
 
 
589 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  35.02 
 
 
629 aa  216  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  33.88 
 
 
627 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  30.59 
 
 
637 aa  188  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0588  putative siderophore biosynthesis protein  28.15 
 
 
564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  32.65 
 
 
600 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  34.47 
 
 
640 aa  107  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  33.62 
 
 
592 aa  104  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  29.54 
 
 
570 aa  99.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  31.36 
 
 
998 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  32.05 
 
 
991 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  31.07 
 
 
998 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  28.32 
 
 
599 aa  94.7  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  25.62 
 
 
602 aa  95.1  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  30.65 
 
 
587 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  25.53 
 
 
653 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  30.52 
 
 
545 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  29.8 
 
 
577 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  27.08 
 
 
610 aa  90.5  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  27.43 
 
 
562 aa  89  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  30.45 
 
 
546 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  31.09 
 
 
563 aa  88.2  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  27.24 
 
 
588 aa  87.4  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.73 
 
 
577 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  26.8 
 
 
656 aa  87.4  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  26.8 
 
 
656 aa  87.4  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  27.79 
 
 
720 aa  78.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  27.87 
 
 
621 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  28.05 
 
 
619 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  29.62 
 
 
655 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  29.6 
 
 
1148 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  29.91 
 
 
610 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  29.12 
 
 
655 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  22.51 
 
 
592 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  22.51 
 
 
592 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  26.16 
 
 
580 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  26.2 
 
 
615 aa  72  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  29.5 
 
 
557 aa  71.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  29.57 
 
 
611 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  25.26 
 
 
563 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.62 
 
 
612 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  26.09 
 
 
589 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  22.97 
 
 
610 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  27.56 
 
 
580 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.67 
 
 
610 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.67 
 
 
610 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.67 
 
 
612 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  28.86 
 
 
615 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.67 
 
 
610 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.47 
 
 
577 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.18 
 
 
612 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  29 
 
 
1153 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  22.03 
 
 
613 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24.77 
 
 
618 aa  62.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  27.33 
 
 
610 aa  62  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  28.65 
 
 
594 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  29.56 
 
 
613 aa  61.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  28.92 
 
 
595 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  23.29 
 
 
591 aa  60.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  34.92 
 
 
570 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  30.7 
 
 
608 aa  60.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  28.31 
 
 
621 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  26.18 
 
 
617 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  26.86 
 
 
810 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  24.57 
 
 
582 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.65 
 
 
580 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  25.32 
 
 
580 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  27.73 
 
 
594 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  28.64 
 
 
672 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  24.01 
 
 
580 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  20.69 
 
 
578 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.43 
 
 
582 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.43 
 
 
582 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  24.43 
 
 
582 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  28.03 
 
 
584 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  21.92 
 
 
602 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  23.49 
 
 
585 aa  54.3  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  26.06 
 
 
684 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  27.36 
 
 
578 aa  54.3  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  21.45 
 
 
615 aa  53.9  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  23.29 
 
 
585 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  23.29 
 
 
585 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  26.91 
 
 
637 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  28.93 
 
 
601 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  27.81 
 
 
625 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  22.71 
 
 
818 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  23.01 
 
 
578 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  23.01 
 
 
578 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  31.29 
 
 
599 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  21.92 
 
 
602 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  28 
 
 
599 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  25.16 
 
 
610 aa  50.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  22.47 
 
 
639 aa  50.4  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  27.87 
 
 
799 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  28.38 
 
 
635 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  32.88 
 
 
596 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  23.41 
 
 
925 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>