257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4567 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  100 
 
 		 98 aa  190  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3048  cytochrome c553  77.61 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.58659  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  41 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  42.5 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  46.58 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  48.65 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  44.74 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  43.21 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  45.33 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  45.33 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  44.16 
 
 		 216 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  45.07 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  39.53 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  39.53 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  45.71 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  40 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  45.33 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 212 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  38.54 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  41.89 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  39.33 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  35.87 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  37.78 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  41.79 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  41.43 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  38.24 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  38.57 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  39.06 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  39.33 
 
 		 256 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  31.11 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 238 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  34.29 
 
 		 243 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 243 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  34.83 
 
 		 227 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1799  cytochrome c family protein  40.58 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000599943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  38.03 
 
 		 265 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 215 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  33.8 
 
 		 246 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 265 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  37.88 
 
 		 219 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 265 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  36.62 
 
 		 545 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 219 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  36.11 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 242 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  40 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  39.19 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  40.3 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  41.43 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  34.94 
 
 		 236 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  34.04 
 
 		 199 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  40 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  40.3 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  41.3 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  32.86 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  38.81 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  35.82 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  44.78 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  35.82 
 
 		 239 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  37.68 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 229 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 202 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  32.88 
 
 		 318 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  35.82 
 
 		 255 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 229 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  36.11 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 236 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  34.33 
 
 		 253 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  34.33 
 
 		 249 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>