More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3961 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  500  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  96.83 
 
 		 252 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  64.68 
 
 		 252 aa  314  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  56.85 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  48.19 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  47.18 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  44.94 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  45.56 
 
 		 261 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  44.35 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  45.97 
 
 		 260 aa  208  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 297 aa  208  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  44.13 
 
 		 258 aa  207  9e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  46.69 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  46.69 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  44 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  41.94 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.74 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.94 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  41.94 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  42.34 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  44.18 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  42.51 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  44.94 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  39.6 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  43.55 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  40.87 
 
 		 265 aa  194  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  42.74 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  40 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  40.87 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  40.73 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  39.34 
 
 		 349 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  40.16 
 
 		 367 aa  185  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  41.27 
 
 		 555 aa  185  6e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 351 aa  184  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  41.7 
 
 		 603 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  39.76 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  41.67 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  42.29 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  41.77 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  39.02 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1827  ABC transporter related  38.06 
 
 		 260 aa  174  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.754325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 247 aa  174  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  37.45 
 
 		 286 aa  174  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  39.68 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  40.56 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  41.34 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  38.46 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6413  ABC transporter related  39.68 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00239235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.48 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  38.25 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6646  ABC transporter related  39.68 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0373686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  38.15 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  38.06 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  39.84 
 
 		 246 aa  169  6e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  37.6 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  42.45 
 
 		 573 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  38.52 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.27 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  40.48 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  37.2 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  38.65 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  39.37 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  38.87 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  37.9 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  39.11 
 
 		 549 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4468  ABC transporter related  38.8 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  37.2 
 
 		 258 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3389  ABC transporter related  39.27 
 
 		 261 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.9 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6244  ABC transporter related  40.08 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.461474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  37.25 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  38.71 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  39.2 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  37.25 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  39.11 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 		 336 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  39.27 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.9 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>