185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2469 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2469  putative prophage repressor  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.244846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  64.05 
 
 		 148 aa  181  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  51.79 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  47.71 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  47.71 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  47.71 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  47.71 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  44.19 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  45.45 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  42.75 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  42.75 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  42.75 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  42.75 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  42.75 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  42.75 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  42.75 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  42.75 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  42.75 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  39.53 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  44.34 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  44.34 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  44.34 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.46 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  44.95 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  46.3 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  40.74 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  40 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  39.84 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  42.45 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  34.87 
 
 		 212 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  35.77 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  40.54 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  38.53 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.52 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  33.93 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  42.2 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  38.28 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  38.28 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  36.09 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  37.61 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  39.09 
 
 		 186 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  37.14 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  35.24 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  33.64 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  37.5 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  37.86 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  37.86 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  39 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.61 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  34.11 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  34.58 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  35.04 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  35.19 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  34.26 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  39.62 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  32.03 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  39.62 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  39.62 
 
 		 168 aa  62  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  35.78 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  36.51 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  36.7 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  31.48 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  31.48 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.33 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  37.27 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.47 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.33 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  30.91 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  30.07 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  34.29 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  37.62 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  33.94 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  31.01 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1916  peptidase S24, S26A and S26B  29.61 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  32.11 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.08 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  29.81 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.88 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  30.1 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  25.32 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  35.45 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  32.69 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2121  RulA protein, putative  28.76 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  28.78 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6846  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  38.27 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.391579  normal  0.145831 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4173  putative prophage repressor  41.67 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  29.1 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  30.77 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  31.15 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  32.67 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  32.08 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.69 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  32.69 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1782  putative prophage repressor  32.67 
 
 		 274 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.91 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.65 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  29.25 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  29.81 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  29.53 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>