270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2157 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  100 
 
 		 392 aa  811    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  47.37 
 
 		 380 aa  356  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  45.62 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  44.85 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  44.15 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  44.33 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  43.09 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  43.19 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  42.86 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  42.06 
 
 		 389 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  42.26 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  41.19 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  41.07 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  40.53 
 
 		 390 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  41.58 
 
 		 382 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  41.64 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  40 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  40.63 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  41.27 
 
 		 374 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  39.74 
 
 		 383 aa  276  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  40.05 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  39.58 
 
 		 374 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  39.27 
 
 		 375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  38.89 
 
 		 374 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  40.21 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  39.02 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  38.52 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  39.95 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  39.37 
 
 		 463 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  40.42 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  40.42 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  39.95 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  39.9 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  38.34 
 
 		 391 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  39.9 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  40.05 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  39.68 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  38.95 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  39.15 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  38.54 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  38.54 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  38.54 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  38.46 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  37.5 
 
 		 376 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  38.02 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  38.28 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  39.2 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  37.93 
 
 		 414 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  37.93 
 
 		 415 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  37.93 
 
 		 414 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  38.68 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  35.62 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  35.62 
 
 		 400 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  38.23 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  38.46 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  37.69 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  35.88 
 
 		 400 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  39.49 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  38.87 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  38 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  38.76 
 
 		 397 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  35.93 
 
 		 400 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  32.89 
 
 		 391 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  37.06 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  34.91 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  36.69 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  35.62 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  38.7 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  31.75 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  38.7 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  31.22 
 
 		 370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  28.43 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  28.54 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  28.54 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  26.6 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  32.19 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  27.04 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  27.17 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  27.68 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  25.6 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  22.79 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  24.78 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  27.88 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  25.22 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  27.2 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  28.45 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  27.2 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  26.26 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  26.79 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  30.13 
 
 		 332 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  27.16 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  26.2 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.66 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  25.66 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  27.51 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  25.64 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  25.91 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  26.07 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  23.87 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  24.23 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>