More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2537 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2537  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  771    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128789  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0770  major facilitator superfamily MFS_1  50.53 
 
 		 388 aa  328  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 384 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1469  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 377 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  29.51 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  29.51 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  29.51 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  29.45 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  29.51 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  29.51 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  29.51 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2295  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.855468  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0747  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 383 aa  137  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  31.04 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  30.77 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  30.77 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  30.77 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  30.77 
 
 		 417 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  28.46 
 
 		 425 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 422 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  26.67 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  28.42 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  24.94 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0581  putative transport protein  25.74 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  27.85 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  26.68 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 417 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 416 aa  119  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  30.08 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  29.75 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 409 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  27.22 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  28.06 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4186  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513939  normal  0.0375994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0834  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  31.84 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1683  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 380 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 419 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  28.88 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  31.15 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 440 aa  106  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 414 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2213  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175074  decreased coverage  0.00000120086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  32.68 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003683  permease  27.92 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02570  arabinose efflux permease family protein  30.5 
 
 		 442 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2978  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 390 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 448 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02138  hypothetical protein  27.56 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>