85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1727 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  83.24 
 
 		 179 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  81.56 
 
 		 179 aa  295  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  66.85 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  32.86 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  24.54 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  29.63 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  26.32 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  24.71 
 
 		 215 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  44.29 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  24.16 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  25.49 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  20.24 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  22.94 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 263 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  22.02 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  34.26 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  22.15 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 253 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 117 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  31.09 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  37.84 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 107 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 372 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  23.17 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 110 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  28.28 
 
 		 255 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  25.48 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  27.16 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  26.09 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 249 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  42.19 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  21.68 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  25.75 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  29.84 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  37.88 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 121 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  37.88 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  37.88 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  37.88 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  37.88 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  21.1 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  29.89 
 
 		 252 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 203 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  31.03 
 
 		 180 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  26.61 
 
 		 316 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  33.8 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  36.36 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 212 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  36.36 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 240 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 210 aa  41.2  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1971  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 114 aa  41.2  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  23.49 
 
 		 226 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  28.7 
 
 		 1433 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>