190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1251 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  98.42 
 
 		 442 aa  863    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 442 aa  874    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  88.01 
 
 		 443 aa  773    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  74.94 
 
 		 443 aa  686    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  98.87 
 
 		 442 aa  869    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  39.71 
 
 		 479 aa  331  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  41.08 
 
 		 492 aa  323  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  38.03 
 
 		 477 aa  318  9e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  37.45 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  40.17 
 
 		 492 aa  299  6e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  36.97 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  36.72 
 
 		 479 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  37.07 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  39.71 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  39.92 
 
 		 489 aa  279  9e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  35.52 
 
 		 559 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  37.95 
 
 		 492 aa  278  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  38.06 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  37.17 
 
 		 537 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  33.83 
 
 		 478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  36.44 
 
 		 476 aa  264  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  39.39 
 
 		 504 aa  263  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  34.63 
 
 		 476 aa  263  4.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  33.33 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  39.26 
 
 		 491 aa  256  8e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  32.55 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  32.85 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  30.85 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  30.71 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  28.3 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  28.76 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  28.09 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  28.42 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  27.04 
 
 		 501 aa  123  6e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  23.64 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.29 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  21.77 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  23.99 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  23.56 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  23.6 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  22.84 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  23.99 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  24.03 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  24.19 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  22.63 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  24.06 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  22.1 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  26.35 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  24.31 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  25.13 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  23.66 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  23.78 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  24.77 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  22.97 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  25.41 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  23.47 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  22.97 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  22.73 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  22.22 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  20.44 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.92 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  20.44 
 
 		 425 aa  57  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  21.73 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  25 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  24.1 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  23.47 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  21.96 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  22.59 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.38 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.27 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.04 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  22.37 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  22.53 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  22.53 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  24.37 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  21.35 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  21.35 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  21.35 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  24.43 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  25.06 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  23.16 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  23.73 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  26.16 
 
 		 423 aa  53.5  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  25.63 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  20.54 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0770  preprotein translocase subunit SecY  22.22 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  24.05 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  20.54 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  22.89 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  22.33 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  21.98 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  22.43 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.36 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>