More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0840 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  62.68 
 
 		 285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.93 
 
 		 284 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.57 
 
 		 284 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  55.52 
 
 		 293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.5 
 
 		 289 aa  335  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.58 
 
 		 284 aa  335  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 		 289 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  54.33 
 
 		 293 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  58.89 
 
 		 271 aa  331  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  53.82 
 
 		 298 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.35 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  54.36 
 
 		 291 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 		 272 aa  315  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  57.93 
 
 		 273 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  58.3 
 
 		 273 aa  314  9e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  58.3 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  59.04 
 
 		 272 aa  312  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  59.04 
 
 		 273 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  55.96 
 
 		 275 aa  288  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  57.56 
 
 		 277 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  56.52 
 
 		 278 aa  278  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  49.81 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  53.51 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  51.25 
 
 		 282 aa  276  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  50.19 
 
 		 269 aa  275  8e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  52.01 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  51.6 
 
 		 284 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  50.89 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  50.18 
 
 		 281 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  50.53 
 
 		 281 aa  265  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  49.08 
 
 		 274 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 		 284 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 		 284 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  48.35 
 
 		 274 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 		 274 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  47.04 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  47.04 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  47.04 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  45.99 
 
 		 274 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  46.49 
 
 		 274 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  46.27 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  48.55 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  49.46 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  46.3 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  35.96 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  29.34 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.41 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.96 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.96 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.57 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.96 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 260 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.96 
 
 		 258 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 249 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.14 
 
 		 255 aa  92.4  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 246 aa  92  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.96 
 
 		 259 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.29 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.51 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 248 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 248 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 249 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 245 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  34.64 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.52 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.92 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0936  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  30.57 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.664798  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 249 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>