74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1921 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  33.82 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  28.45 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.11 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 157 aa  45.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 270 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 270 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 270 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 270 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 158 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  34.83 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.08 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 270 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  32.31 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 329 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 164 aa  42  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 136 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 136 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 136 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 136 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 178 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 208 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 214 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 150 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 168 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 136 aa  41.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 172 aa  41.2  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  26.03 
 
 		 162 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>