75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1587 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 395 aa  777    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  40.17 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  35.83 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  38.14 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  35.03 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  31.38 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  27.2 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  28.65 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  28.21 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  26.61 
 
 		 400 aa  103  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  26.53 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  31.47 
 
 		 285 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  25.71 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  27.18 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  27.47 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  29.09 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  28.36 
 
 		 282 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  25.24 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  23.44 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.93 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  24.77 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  26.44 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  26.16 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  27.78 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  23.31 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  26.11 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  25.11 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  23.01 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  26.54 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  29.6 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  27.83 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  25.5 
 
 		 282 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  26.34 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  21.58 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  26.87 
 
 		 269 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  25 
 
 		 284 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  28.19 
 
 		 342 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1809  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.62 
 
 		 630 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.44 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  27.52 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  40.62 
 
 		 467 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  29.91 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  23.32 
 
 		 553 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  36.11 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  36.11 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.39 
 
 		 506 aa  46.2  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  27.46 
 
 		 345 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  34.78 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  28.44 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  31.78 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  28.35 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_002936  DET1285  serine protease  37.5 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  18.71 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  36.25 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  27.84 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.99 
 
 		 544 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0166  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.77 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  27.17 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  28.7 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  37.5 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  27.47 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  33.78 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  31.07 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  33.78 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  33.78 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  36.36 
 
 		 450 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  26.67 
 
 		 280 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.15 
 
 		 523 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4524  PDZ/DHR/GLGF  30.43 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  36.92 
 
 		 535 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  36.92 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  33.78 
 
 		 451 aa  43.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  39.77 
 
 		 493 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  28.64 
 
 		 291 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  26.59 
 
 		 295 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>