100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1427 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  78.46 
 
 
741 aa  1138    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  100 
 
 
739 aa  1501    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  78.46 
 
 
741 aa  1138    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  78.46 
 
 
741 aa  1138    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  34.08 
 
 
719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  34.08 
 
 
719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  34.08 
 
 
719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  34.08 
 
 
719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  34.08 
 
 
719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  34.08 
 
 
719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  34.08 
 
 
719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  31.32 
 
 
724 aa  303  9e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  31.32 
 
 
724 aa  303  9e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  31.32 
 
 
724 aa  303  9e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  31.32 
 
 
724 aa  303  9e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  35.67 
 
 
498 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  23.82 
 
 
630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  23.82 
 
 
630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  23.82 
 
 
630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  23.82 
 
 
630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  23.82 
 
 
630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  23.82 
 
 
630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  23.82 
 
 
630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  37.7 
 
 
637 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  32.32 
 
 
721 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  32.32 
 
 
737 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  32.32 
 
 
721 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  35.23 
 
 
663 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  30.67 
 
 
491 aa  89.7  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  29.92 
 
 
426 aa  89  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  27.56 
 
 
675 aa  71.6  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  25.36 
 
 
710 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  25.36 
 
 
710 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  25.36 
 
 
710 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  27.24 
 
 
637 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  28.91 
 
 
684 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  28.91 
 
 
701 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  28.91 
 
 
708 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  27.08 
 
 
637 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  28.84 
 
 
608 aa  58.9  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  28.84 
 
 
608 aa  58.9  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  28.84 
 
 
608 aa  58.9  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  23.1 
 
 
461 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  37.18 
 
 
322 aa  54.7  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  27.56 
 
 
797 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  27.56 
 
 
797 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  27.56 
 
 
797 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  32.54 
 
 
617 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  32.54 
 
 
617 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  28.8 
 
 
310 aa  52  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  26.17 
 
 
827 aa  51.2  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  28.42 
 
 
201 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  27.64 
 
 
328 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  29.95 
 
 
367 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  35.9 
 
 
322 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.87 
 
 
409 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  30.77 
 
 
398 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  26.45 
 
 
744 aa  48.9  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  38.16 
 
 
618 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  28.08 
 
 
681 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  27.54 
 
 
324 aa  47.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  28.32 
 
 
324 aa  47.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.97 
 
 
381 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  60 
 
 
403 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  44.64 
 
 
415 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  27.75 
 
 
324 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  48.98 
 
 
297 aa  46.6  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  46.81 
 
 
285 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  28.44 
 
 
359 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  29.17 
 
 
647 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  29.17 
 
 
647 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  29.17 
 
 
647 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  56.76 
 
 
321 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  25.84 
 
 
310 aa  45.8  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  56.76 
 
 
326 aa  45.8  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  40 
 
 
356 aa  45.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  56.76 
 
 
340 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1451  phage integrase family protein  43.14 
 
 
182 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0649583 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  52.63 
 
 
323 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  56.76 
 
 
340 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1183  phage integrase family protein  43.14 
 
 
182 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  41.07 
 
 
356 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  29.95 
 
 
295 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  55.56 
 
 
218 aa  45.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.48 
 
 
324 aa  45.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  37.78 
 
 
290 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  38.37 
 
 
401 aa  45.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  37.5 
 
 
436 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0457  integrase family protein  54.05 
 
 
182 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.093942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  50 
 
 
322 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1628  phage integrase family protein  54.05 
 
 
182 aa  45.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  21.59 
 
 
517 aa  44.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  28.44 
 
 
395 aa  44.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  28.44 
 
 
312 aa  44.7  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  54.05 
 
 
337 aa  44.3  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  26.92 
 
 
323 aa  44.3  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  38.89 
 
 
319 aa  44.3  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  46.51 
 
 
452 aa  44.3  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  38.89 
 
 
319 aa  44.3  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  38.89 
 
 
319 aa  44.3  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>