More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1426 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  84.13 
 
 		 399 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  100 
 
 		 401 aa  812    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  84.13 
 
 		 399 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  84.13 
 
 		 399 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  40.61 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  40.61 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  40.61 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  40.61 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  40.61 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  40.61 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  40.61 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  38.64 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  38.64 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  38.64 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  38.64 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  34.35 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  29.37 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  37.5 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  33.51 
 
 		 364 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  33.51 
 
 		 364 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  33.06 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  34.22 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  26.3 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  28.38 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  23.33 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  33.03 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  24.55 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  24.55 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  24.55 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  24.86 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  26.04 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  33.99 
 
 		 519 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  39.29 
 
 		 141 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  34.09 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  23.66 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  30.68 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.61 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.61 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  32.29 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  30.2 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.86 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  25.7 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  27.22 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.8 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.27 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.71 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  33.15 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.86 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1434  integrase family protein  28 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  32.5 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  28.31 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.87 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.87 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.87 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.87 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.15 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  27.11 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  31.43 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  31.84 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  31.34 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  31.55 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.54 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  28.17 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2492  integrase family protein  28.28 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  26.84 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 310 aa  57  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  26.15 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.61 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  24.66 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  26.98 
 
 		 307 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.8 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  23.16 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  24.51 
 
 		 300 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  31.71 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>